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Die Service-Provider bieten ihren Kunden mit SOLiD eine Komplettlösung für unterschiedliche Anwendungen. So können Wissenschaftler Daten leichter identifizieren, sammeln und analysieren. Dadurch wird es künftig einfacher, den Einfluss von DNA- oder RNA-Variationen auf ein Krankheitsbild zu erforschen. Zu den zahlreichen Applikationsmöglichkeiten des SOLiD gehören die Sequenzierung vollständiger Genome, die Chromation-Immunopräzipitation (ChIP), mikrobielle und eukaryontische Resequenzierung, digitales Karyotyping, medizinisches Sequenzieren, Genotyping, Genexpression sowie der Nachweis kleiner RNAs.

Zu den aktuellen Teilnehmern des Programms zählen die Agencourt Bioscience Corporation (USA), GATC Biotech (Deutschland), Seqwright DNA Sequencing (USA) und Sistemas Genomicos (Spanien). Diese führenden Service-Provider gehören zu den ersten SOLiD-Kunden von Applied Biosystems. Sie alle besitzen ein umfangreiches Dienstleistungsangebot, einschließlich der Ultrahochdurchsatz-Genomanalyse. Auch das Entwerfen von Analyseprotokollen, die Datenverwaltung und -analyse gehören zum Service.

Teilnehmer des Next-Generation-Service-Provider-Programms

Zu den Teilnehmern gehört die Agencourt Bioscience Corporation, eine Tochtergesellschaft von Beckman Coulter, Inc. Die Firma besitzt ein SOLiD-System, ein zweites Gerät ist bereits angefordert. Applied Biosystems arbeitet seit einigen Jahren mit Agencourt zusammen. Zu den Projekten gehört eine Mutations-Detektionsstudie bei der Ethanol produzierenden Hefe Pichia stipitis.

„Wir sind mit den Daten, die wir mit der SOLiD-Plattform erzeugen, äußerst zufrieden. Wir bearbeiten zahlreiche weitere Kundenprojekte, zum Beispiel Resequenzierungsstudien und Untersuchungen zum Nachweis von Methylierungsmustern", so Erick Suh, Direktor von Agencourt Genomic Services. „Wenn wir zwei Systeme besitzen, können wir die Bandbreite unseres Angebots vergrößern und unsere Kunden aus Industrie und Forschung noch besser bedienen."

GATC ist ein deutscher Service-Provider. Sein Angebot und seine Expertise auf dem Gebiet der DNA-Analyse werden von strategischen Partnern aus Universität und Industrie genutzt. Dazu gehören Kunden, die bis zu 100 menschliche Genome bis Ende 2010 sequenzieren wollen. Durch die Kombination des SOLiD-Systems mit einem Serviceangebot im Bereich Bioinformatik sollen die Gesamtkosten für die Sequenzierung reduziert werden.

„Wegen seiner Mate Pair-Bibliotheken mit großen Insertionen ist das SOLiD-System ideal zur Identifizierung von Indels, Rearrangements und Strukturvarianten", so Peter Pohl, CEO von GATC. „Wir haben Sequenzieraufträge für das neue SOLiD-System erhalten noch bevor seine Installation abgeschlossen war."

Ein Dienstleister für die akademische und pharmazeutische Forschung, und zwar seit mehr als dreizehn Jahren, ist die Firma SeqWright in Houston, Texas. Der Service-Provider bietet ein großes Portfolio an genetischen und molekularbiologischen Dienstleistungen. Die Einführung des SOLiD wird die Stärken der Firma SeqWright auf dem Gebiet des Contract Sequencing untermauern. Das Unternehmen arbeitet seit vielen Jahren mit Applied Biosystems zusammen.

„Sowohl unsere neuen als auch die langjährigen Kunden erkennen das Potenzial, das hinter der SOLiD-Plattform steckt. Sie alle sind gespannt darauf, von unseren Experten in die neuen Technologien und Applikationsmöglichkeiten eingeführt zu werden", so Dr. David Buck, Vice President of Operations bei SeqWright. „Die Flexibilität und Genauigkeit wie auch die Möglichkeiten zur Datengeneration machen Projekte möglich, die vor der Einführung des SOLiD die Budgets vieler Forscher sprengten. Wir freuen uns, die wissenschaftliche Zukunft unzähliger spannender Projekte mitgestalten zu können."

Sistemas Genómicos in Spanien ist ein international führender Anbieter integrierter Lösungen in den Bereich Genomanalyse und Molekularbiologie. Mit ihrem SOLiD-Gerät wird die Firma künftig sowohl bei nationalen als auch bei internationalen Forschungs­projekten auf Gebieten wie der Qualitätsprüfung von Nahrungsmitteln oder der Erforschung von Krankheiten genetischen Ursprungs verstärkt mitwirken.

„Wir haben vor allem zum Thema Whole Genome Sequencing eine Reihe von Kundenanfragen erhalten. Wir glauben, dass das SOLiD-System wegen seiner Geschwindigkeit und Flexibilität für diese Kunden attraktiver ist als andere Next-Generation-Sequencing-Systeme", so Professor Manuel Pérez-Alonso, wissenschaftlicher Manager von Sistema Genómicos. „Der hohe Durchsatz der Plattform ermöglicht die kosteneffiziente Genomsequenzierung unterschiedlichster Anwendungen, zum Beispiel dem Deep Sequencing oder der vergleichenden Genomanalyse."

Das SOLiD-System setzt neue Maßstäbe für das Next Generation Sequencing

Applied Biosystems besitzt eine besonders robuste Produktserie von automatisierten Kapillarelektrophorese-Systemen für die genetische Analyse. Das Unternehmen setzt mit der Einführung von SOLiD neue Maßstäbe unter den Sequenzier-Plattformen der nächsten Generation. Das gilt sowohl in Bezug auf Durchsatz als auch auf Genauigkeit, Robustheit und Skalierbarkeit des Systems. Mitglieder des SOLiD-Service-Provider-Programms erhalten von Applied Biosystems technische Unterstützung und Marketingsupport. Außerdem werden die Dienstleister dabei unterstützt, ihr Angebot den Kunden vorzustellen.

„Über unser Service-Provider Programm wollen wir mehr Anwendern die Analysetechnologie der nächsten Generation zur Verfügung zu stellen", konstatiert Kim Caple, Vice Präsident und General Manager des Bereichs Next Generation Sequencing von Applied Biosystems. „Wir kooperieren mit den Service-Providern, damit wir SOLiD einer breiteren Öffentlichkeit zugänglich machen können. So können Wissenschaftler ihre Forschungarbeiten schneller durchführen, und die genetische Ursache bestimmter Krankheitsbilder wird einfacher zu erforschen sein."

Das SOLiD-System basiert auf dem Prinzip der Oligonukleotid-Sequenzierung durch Ligation und Detektion. Das System ist eine Komplettlösung für die genetische Analyse. Es besteht aus einer Sequenziereinheit, Chemikalien, einem Rechner und einem Datenspeicher. SOLiD ist im industriellen Bereich derzeit das Sequenziersystem mit dem höchsten Durchsatz: Vier Gigabasen können pro Lauf sequenziert werden. Seine Rohbasen-Genauigkeit ist mit 99,94 Prozent einzigartig. Dahinter steckt das Prinzip des 2-Base-Encoding, ein Mechanismus, der zufällige oder systematische Lesefehler von echten Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) unterscheidet.

Wenn Sie weitere Informationen zu SOLiD wünschen oder ein SOLiD-Service-Provider werden wollen, besuchen Sie unsere Website solid.appliedbiosystems.com.

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PR-Agentur